Une centrale électrique subit de mystérieuses attaques par Neronga, un monstre invisible se nourrissant d'électricité. Souhaitant éviter la catastrophe, la Patrouille scientifique et l'armée confrontent la bête avec leur savoir-faire technologique. Mais lorsque Neronga refait son apparition, le pire est à prévoir. Hayata se sépare du groupe et, muni de sa capsule Bêta, devient Ultraman pour engager le combat.