Överste Jonathan Smith är en sjukdomsspecialist och fd hemlig agent för Covert One, en elitunderrättelsebyrå som upprättats för att rapportera direkt till presidenten. När ett nytt okänt supervirus dyker upp, med potential att slå ut stora delar av civilisationen, kallas Smith in i tjänst igen för att isolera smittan. Av producenterna bakom "The Bourne Identity" och "The Bourne Supremacy".